由深圳市人民政府和清华大学共同创办，为深圳二次创业和清华大学创建世界一流大学服务，研究院是以企业化方式运作的局级事业单位，实行理事会领导下的院长负责制，总体目标是建成我国一流的产学研基地，逐步发展成为面向港澳台，面向世界的技术创新，人才培养和学术交流中心。经过数年发展，目前控股资产已达到几十亿元。